Geneious,

唯一的用戶友好的系統(tǒng)發(fā)育分析軟件

對(duì)齊序列，使用您選擇的算法構(gòu)建和查看系統(tǒng)發(fā)生樹，并編輯圖像進(jìn)行發(fā)布 - 全部在一個(gè)程序中。

內(nèi)置可能性，距離和貝葉斯樹的構(gòu)建方法

交互式距離矩陣查看器可以讓您快速計(jì)算有意義的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)以進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析

發(fā)育樹建設(shè)和查看沒(méi)有雜文件

只需在Geneious中選擇任何對(duì)齊方式，然后選擇算法即可通過(guò)簡(jiǎn)單的單擊方法生成您的發(fā)育樹

您選擇的樹木算法

鄰居加入 - 使用快速簡(jiǎn)單的鄰居加入方法在幾秒鐘內(nèi)為大量分類群建立自己的引導(dǎo)樹

UPGMA - 用于系統(tǒng)發(fā)育重建的簡(jiǎn)單快速分層聚類方法

MrBayes - 對(duì)于貝葉斯系統(tǒng)發(fā)育的估計(jì)，Geneious合并了可以在本地機(jī)器上運(yùn)行的MrBayes插件。

PAUP * - 通過(guò)我們精簡(jiǎn)的GUI界面從Geneious內(nèi)部啟動(dòng)PAUP 插件，以執(zhí)行Maximum Parsimony，Maximum LIkelihood。您必須擁有或購(gòu)買PAUP 的副本才能使用此插件

PhyML - 利用PhyML插件最大限度地實(shí)現(xiàn)最大可能性

用于快速似然推斷的GARLI-遺傳算法

RAxML-隨機(jī)化軸向最大似然

FastTree - 核苷酸或蛋白質(zhì)序列比對(duì)的近似最大似然系統(tǒng)發(fā)育樹

導(dǎo)出您的系統(tǒng)發(fā)育圖稿并發(fā)布

操作顯示設(shè)置來(lái)自定義分支標(biāo)簽，節(jié)點(diǎn)標(biāo)簽，結(jié)束標(biāo)簽，樹形狀，樹形比例或顏色分支，讓您的樹看起來(lái)完全符合您的需要。一旦你的樹建成保存為高品質(zhì)的矢量格式，如svg，pdf或eps用于發(fā)布或打印它，以便您可以將其粘貼在墻上。